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Soutenance de thèse de Louise Paillat

Campus d'Angers

Rôle des microorganismes de la rhizosphère sur la disponibilité des nutriments en milieu complexe substrat-engrais organiques- Implications pour la croissance et la nutrition du basilic en culture hors-sol

Thèse dirigée par Patrice Cannavo, unité propre de recherche EPHor

Résumé

En horticulture, les préoccupations environnementales poussent à la diversification des substrats organiques de culture, en substitution à la tourbe, et à l’utilisation d’engrais organiques. Les nutriments contenus dans ces derniers doivent être minéralisés par les microorganismes avant d’être disponible pour la plante. Cette thèse vise ainsi à caractériser les fonctions microbiennes impliquées dans la disponibilité des nutriments N, P et S. Trois expérimentations ont été conduites à différentes échelles et mettent en jeu différents couples substrats x engrais organiques pour caractériser la minéralisation des engrais, le fonctionnement rhizosphérique et l’efficience d’utilisation des nutriments par le basilic. Nos résultats montrent que le type de substrat détermine l’expression des activités enzymatiques et les dynamiques de minéralisation N P et S, tandis que le type d’engrais organique module ces réponses. Un fort effet rhizosphère sur les activités microbiennes en lien avec le cycle du N est démontré par approche cartographique-2D. La fertilisation stimule encore plus ces activités permettant une augmentation de la disponibilité du N au niveau de l’engrais et de biomasse du basilic. Sous serre, une production de basilic de qualité est obtenue, pour tous les couples substrat x engrais sauf dans les substrats dérivés du bois en raison d’une forte compétition pour le N entre microorganismes et plante. En culture hors-sol, la fertilisation organique nécessite donc d’être réfléchie en fonction du substrat organique et des objectifs de production.

Mots clés : minéralisation, activités enzymatiques, efficience d’utilisation des nutriments, azote, phosphore, cartographie 2D